使用している会計ソフトの勘定科目をそのまま取り込めますか?

はい、可能です。

「勘定科目設定」や「補助科目設定」にて、現在お使いの会計ソフトと同じコード・名称を登録できます。これにより、出力される仕訳データがそのまま会計ソフトにインポート可能となり、データ変換の手間がなくなります。